种子在催芽过程中常出现“根芽不齐”的现象，有时有根无芽或根很短，有时根长而芽很短。
产生根芽不齐的原因是由于温度和温度控制不当造成的，谷堆水分不均匀，水分多，氧气少的地方由于“湿长根”则出现芽长根短的现象；水分少，氧气多的地方，由于“干长根”则出现根长芽短现象；谷堆温度不均匀，一般谷堆中心温度高，氧气少，则出现“热长根”的现象，幼根生长快，芽生长慢；谷堆四周及表面温度低，氧气足，幼根生长慢，但芽鞘伸长受温度影响较小，则出现“冷长芽”的现象。
因此在破胸前后，应充分协调水分、温度和氧气条件，均匀翻拌种子，防止“根芽长短不齐”。
