收储政策的“副作用”愈加突显，收储“进退两难”的窘境越发突出。在中华粮网信息主编焦善伟看来，“托市和临储政策扭曲了市场，造成了社会资源的浪费，多数市场经济发达的国家均已抛弃这种政策，我国的粮食收储政策已经到了非改不可的地步。”
调整收储政策同样是企业的呼声。黑龙江龙江福粮油有限公司董事长宋胜斌告诉中国证券报记者，现在国家收储处于一个“两难”境地，价格定高或定低都有可能影响到豆农或压榨厂的利益。“如果国储价高于大豆压榨企业的成本，相对进口大豆的价格差距更大，压榨厂就无力收购;如果国储价过低，又会影响豆农收入和种植积极性，种植面积或将进一步缩减。”
正如宋胜斌所言，收储不仅导致国际国内市场大豆价格出现倒挂，而且不少加工企业遭受损失。2013年大豆临时收储价4600元/吨，美国大豆进口折算到港成本不到4200元/吨，南美豆更是低至4000元/吨左右。东北地区以国产大豆为原料的加工企业已基本全部停产，沿海大型大豆加工企业的原料基本全部依靠从美国和南美巴西、阿根廷进口，年进口量6900万吨。
无独有偶，棉花收储同样如此。因收储棉花价格高于外棉价格，国内棉花市场与国际棉花市场严重脱节，出现价格倒挂，致使纺织企业出现大面积亏损。由于进口配额有限，甚至有企业从倒卖配额指标中获利。
除此之外，近两年来收储造成的棉花高库存，加剧了收储政策“进退两难”的窘境。根据相关统计，过去两年我国收储棉花达到1000万吨，占全球库存的60%，如果继续收储，资金压力将加大，国家财政不堪重负;如果放出库存，市场剧烈波动，又将伤及国内棉农，重创我国棉花产业。
因此，调整收储制度已势在必行。“国家把对农民的保护和补贴直接补给农民，而不是通过单单一个收储价格进行保护，这既有助于提高农民种豆的积极性，又能使大豆价格在没有国储定价的情况下，完全由市场决定。”宋胜斌说，保护农民利益的同时，也有利于大豆企业的发展和整个大豆产业链的循环。
